role of microRNAs in controlling protein expression noise
By (author) Jorn Schmiedel
Paperback (Published)
(March 2016)
ISBN: 9783832542160
5.71 x 8.27 inches
Price: $60.00
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Der Expression von Genen liegen stochastische Prozesse zu Grunde, die zu Fluktuationen in der Menge von Proteinen eines jeden Gens fuhren. Zu starke Fluktuationen in Proteinmengen konnen fur Organismen schadlich sein, da die meisten zellularen Prozesse auf der prazisen Wechselwirkung von Proteinen beruhen. Diese Dissertationsschrift befasst sich mit dem Einfluss von post-transkriptionellen Regulationsmechanismen auf die stochastischen Prozesse der Genexpression. Mittels bioinformatischer Datenanalyse, mathematischer Modellierung und gezielten Einzelzellexperimenten wird mit Fokus auf die in Mehrzellern weitverbreiteten microRNAs erforscht unter welchen Voraussetzungen Organismen post-transkriptionelle Regulation zu Verringerung von Fluktuationen benutzen konnen. Die zentrale Erkenntnis der vorliegenden Arbeit ist, dass microRNAs fur die meisten Gene Fluktuationen verringern konnen und auch zu diesem Zweck genutzt werden.
1 Noise Arising from Protein Production is Minimized for Noise-Prone Genes 1.1 Introduction 1.2 Results 2 MicroRNA Control of Protein Expression Noise 2.1 Introduction 2.2 Mathematical model of microRNA noise effects 2.3 Experimental validation of microRNA noise effects 2.3.1 Experimental validation of noise effects for miR-20a in mouse embryonic stem cells 2.3.2 Generality of intrinsic noise reduction for microRNAs and other post-transcriptional repressors 2.3.3 Additional extrinsic noise from individual and mixed microRNA pools 2.4 micro RNA noise effects in endogenous target situations 2.5 microRNAs predominantly increase production ratios 2.6 Noise-sensitive genes are enriched for microRNA regulation 3 Conclusions and Outlook 3.1 Protein expression noise in mammalian cells 3.2 microRNA control of protein expression noise in mammalian cells 4 Materials & Methods 4.1 Bioinformatics 4.2 Experiments 4.3 Measuring fluorescent protein variability on a flow cytometry 4.4 GO Term microRNA regulation References
- By (author) Jorn Schmiedel
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